Начало свое церковь получила в царствование императора Петра I. При первоначальном заселении новой столицы на Адмиралтейском острове, между речками Мойкою и Глухою (ныне Екатерининский канал), поселены были так называемые Переведенские слободы в двух улицах — Большой и Малой Переведенских; здесь находилась также и слобода адмиралтейского батальона.
Вследствие умножения приходских людей, а также и отделенности их от приходской церкви Исаакия Далматского, поставлена была в поле походная часовня. В то же время корабельный подмастерье Ф. Пальчиков с товарищами вошел в адмиралтейскую коллегию с просьбой о дозволении построить близ Переведенских слобод деревянную церковь во имя Вознесения Господня с приделом Иоанна Воинственника. На просьбу его адмиралтейская коллегия резолюцию положила:
Лавры, монастыри и храмы на Святой Руси. Санкт-Петербургская епархия. // Сост.: Э. А. фон-дер-Брюгген, Н. М. Евреинов, СПб, 1909.
«Приискать удобное в тех слободах место и помогать к тому строению потребными лесами от адмиралтейства, а на наём плотников и украшение церкви собирать просителям от себя и для такого сбора учинить книгу, которую пусть поручат, кому верят».
Место было выбрано за Глухой речкою близ проспекта, что от Синего моста к реке Фонтанке.
По отпуске из адмиралтейской коллегии первоначальных строительных материалов была заложена деревянная церковь по указу святейшего синода от 31 августа 1728 года, а в ноябре того же года был окончен придел во имя святого Иоанна Воина и по указу святейшего синода преосвященным Рафаилом, епископом Псковским и Нарвским, освящен, с положением в оный данного синодом освященного антиминса.
Постройка церкви затем продолжалась теми же средствами и была окончена в половине марта 1729 года; 20 марта дан от святейшего синода указ на освящение храма Вознеcения Господня епископу Рафаилу и прислан антиминс, печатанный деревянною гравированною доской, найденною между типографскими материалами синода.
Первоначальная деревянная церковь, а равно и иконостас были устроены по рисунку архитектора Коробова. В алтаре над престолом устроена была сень. Иконостасы были раскрашены и по местам вызолочены; потолок и алтарь расписаны. На колокольне было пять колоколов; через Глухую вел к церкви широкий мост, ограда церкви была обсажена деревьями (на том месте, где построен Вознесенский храм, была тогда березовая роща).
В 1730 году по распоряжению адмиралтейской коллегии, архитекторский гезель Гр. Селезнев выстроил над церковью шпиц; на колокольне в то время уже было 9 колоколов, а в декабре того же года из Москвы были присланы: напрестольное евангелие, два серебрянных позолоченных блюда, медное кадило высеребрянное, две медных лампады, книга Кирилла Транкиллиана и все потребные при богослужении церковные книги. В январе 1732 года к приезду императрицы Анны Иоанновны повелено было устроить в церкви царское место и обить его красным сукном.
Спустя 20 лет причт и прихожане церкви исходатайствовали разрешение построить каменный, общирный храм пятиглавый с особой колокольней. Каменная церковь была заложена 4 июня 1755 года. По первоначальному плану храм разделялся на теплый и холодный. В теплой западной части устроены были два придела. Первый, слева от входа, во имя святого велкомученника Иоанна Воина освящен июля 30 дня 1764 года, второй с правой стороны, во имя Божией Матери «Утоли моя печали» в точной копии с находящегося в московской церкви святого Николая-чудотворца, что на Папышах.
Холодная церковь во имя Вознесения освящена в 1769 году мая 28 дня. В ней святой престол был украшен сенью резной работы из дерева, в колоннах сени находились вырезанные из дерева изображения святых ангелов в человеческий рост.
Иконы храма написаны художником Колокольниковым, живопись которого существует и до настоящего времени в иконостасе верхней церкви Никольского собора. В 1796 году на углу церковной ограды построена была каменная часовня.
В год столетнего юбилея церкви в 1869 году последняя была обновлена как внутри, так и снаружи.
Главный храм построен был квадратный; длина его 35 саженей 1 1/2 аршин, ширина 12 саженей 2 аршина и высота 14 саженей 8 вершков. Главный иконостас в четыре яруса, с образом Господа Саваофа, иконостасы в три яруса.
Особое усердие к украшению икон в иконостасе проявил бывший церковный староста, купец Савелий Королев; он устроил серебряные позлащенные ризы на иконы Христа Спасителя и Богоматери у царских врат и на весь верхний ярус над царскими вратами. На горнем месте, в особо устроенной киоте над небольшой сенью помещается образ Христа Спасителя во весь рост человека, на троне со скипетром и державою в руках. Образ писан на полотне в 1842 году художником Яковлевым.
При церкви Вознесения Господня находится колокольня в три яруса; на ней имеется пятнадцать колоколов.
Святыни и достопримечательности храма: древняя и замечательная икона в храме Божией Матери «Утоли моя печали», привезенная из Москвы ко дню освящения придела в честь ея в 1765 году; риза на ней серебряная, вызолоченная, украшенная бриллиантами и другими драгоценными камнями. Икона поставлена в особо устроенной в 1829 году серебряной киоте, работы Помо. Другая икона, тоже древняя и замечательная, это икона великомученника Иоанна Воина, в честь коего на левой стороне церкви устроен придел.
Древнейший из сосудов — небольшой серебряный вызолоченный в 1727 и 1728 года, при нем дискос 1749 года. Дркгой лревний прибор, состоящий из потира, дискоса, звездицы, двух блюдцев и лжицы пожервован в 1762 году в придел Иоанна Воина.
Из напрестольных крестов замечателен по древности шестиконечный вызолоченный с гравированным на нем изображением Распятия и над ним померкших солнца и луны. Крест был сделан, как видно из надписи, в 1685 году для церкви Антипа, епископа пергамского чудотворца. Другой крест небольшой серебряный в 1790 году пожертвован на поминовение рабы Божией Ксении.
Из напрестольных евангелий, кроме присланного из Москвы в 1750 году, есть другое древнее евангелие царствования императрицы Елизаветы Петровны с серебрянными вызолоченными евангелистами и в середине образ Вокресения. В церкви находятся два евангелия. Последнее по времени большое евангелие в серебряном вызолоченном окладе, изящной отделки, было сделано в 1750 году усердием покойного протоиерея Кирилла Воцкого на церковную кошельковую сумму.
Из дароносиц древнейшая 1739 года весом 4 фунта 37 золотников с вычеканенным на верхней деке изображением Тайной Вечери. Древнейший ковчег тоже 1739 года, имеется другой ковчег в форме часовни, вероятно более древний, но год не обозначен; на главном престоле большой ковчег, новейшей фирмы работы Верховцева, пожертвованы женой протоиерея Варварой Михайловною Доховскою.
Из священнических облачений замечательны по благолепию и ценности шесть священнических риз и шесть стихарей диаконских; ризница пожертвована в 1873 году почетным гражданином Алонкиным.
Церковная библиотека существует с 1730 года, она состоит из книг богословского содержания и из разных духовных журналов.
Церковь Вознесения Господня ограждена каменною оградою с железными решетками. Из сохранившейся при церкви надгробной надписи видно, что прежде при ней было кладбище, и что на нем 20 июня 1729 года погребен Симеон Ширяев, бывший участником и сотрудником в устройстве первоначальной деревянной вознесенской церкви. Другая надпись на медной доске была прибита в самом храме при входе на левой стороне, где было погребено в 1764 году тело Затрапезникова. Из надгробных памятников в ограде церкви сохранился памятник на могиле первого вознесенского священника Федора Мокиевича Толстошеева, умершего в 1734 году. Памятник состоит из каменной плиты, на которой выбита и до настоящего времени сохранилась обыкновенная надгробная надпись.
При церкви Вознесения Господня находится общество попечения о бедных, вступившее в 34 год своей деятельности.
Благотворительность общества попечения о бедных заключается в следуюшем: 1) выдача денежных пособий бедным, 2) призрении в богадельне престарелых и увечных, 3) призрении, воспитании и обучении детей мальчиков и девочек живущих и 4) приходящих в приют-школу.
При обществе имеется богадельня, открытая 1-го ноября 1872 года, в котрой находится 45 старушек.
Кроме того, имеется еще дневной приют-школа с отделением имени тайного советника Константина Алексеевича Рыбина. Первый открыт 1 ноября 1872 года, отделение — 1 октября 1893 года. В приюте содержатся дети обоего пола. Заведующим приютом более 25 лет состоит диакон Александр Иванович Тихомиров. Попечительницей отделения состоит Мария Петровна Синицина, надзирательницей — Наталия Петровна Фрей.
В богадельне имеются следующие кровати: И. и М. Трухмановых, К. Я. Шестакова, И. и А. Масловых, Ф. Давыдовой и др.
Призрение детей обего пола открыто 1-го октября 1884 года. К 1 января в призрении состояло 22 детей обоего пола.
Должностными лицами избраны: председателем протоиерей А. С. Лебедев, товарищем председателя П. С. Бочагов и Н. А. Кривицкий, казначеем С. Д. Зимин, экономом И. М. Хрусталев и делопроизводителем диакон А. И. Тихомиров.
Совет общества составляли: протоиереи А. С. Лебедев, А. А. Черенский, П. П. Виноградов, А. М. Иванов, священник А. К. Максимов и диаконы А. И. Тихомиров и А. М. Рыборецкий. Умершие члены общества: спб купец Я. Акимов-Перетц, Ф. М. Мартынов, Н. К. Кузьмин, В. А. Киселев, И. И. Пирогов и А. Д. Водеников.
Настоятелем церкви Вознесения Господня состоит протоиерей Алексей Сергеевич Лебедев, церковным старостой до 1906 года состоял купец Сергей Дмитриевич Зимин, в настоящее время в должности церковного старосты состоит Павел Степанович Бочагов.